Apellido castellano, probablemente originario del lugar de Malaguilla (cuyo nombre tomó), perteneciente a la provincia de Guadalajara. Una familia radicó en Madrid.

Ingresaron en los colegiales del Mayor de San Ildefonso y menores de Alcalá: Antonio Malaguilla, natural de Hita (Guadalajara), en 1674; José Malaguilla, natural de Sigüenza (Guadalajara), en 1692; Juan de Malaguilla, vecino de Hita, en 1666; Tomás Malaguilla, natural de Alovera (Guadalajara), en 1784; Antonio Malaguilla Gutiérrez Blas y Pérez, natural de Trijueque (Guadalajara) y originario de Hita, en 1694; Juan Tomás Malaguilla Perdiguero Díaz y Martínez, natural de Hermosa de Llovero, en 1792; y Juan Tomás Malaguilla Reguero Díaz y Martínez, natural de Alovera y originario de Pioz (Guadalajara), en 1780.

Antonio Malaguilla Gutiérrez, natural de Trijueque, probó su limpieza de sangre para ejercer el cargo de Oficial del Santo Oficio de la Inquisición en 1709.

En gules, una banda, de oro, engolada en cabezas de dragantes, de sinople.